1、冷凍離心機較長時間不使用或者維修時應將主電源插頭取下。否則儀器會帶電，特別是維修時易發生安全事故。
2、轉子不用時應從離心腔內取出，及時用中性洗滌液清潔擦干，防止化學腐蝕，存放在干燥通風處。不允許用非中性清潔劑擦洗轉子，不允許用電熱風吹（烘）干轉子。轉子中心孔內應涂少許潤滑脂保護。
3、冷凍離心機為了保護制冷壓縮機，儀器斷與通電間隔時間必須大于3分鐘，否則損傷壓縮機。
4、聚丙烯（PP）離心管（瓶）不能與濃硝酸（95％）、王水、甲苯、苯、汽油、煤油、等接觸使用。超凈工作臺聚碳酸酯（PC）離心管（瓶）不能與氫氟酸、鹽酸（30％、50％）、硫酸（10％）、硝酸硝酸（95％）、王水、氫氧化鉀、氫氧化鎂、氫氧化氨、氟化鋁、硫化銨、醋酸銨、碳酸銨、硝酸鈉、鉻酸（50％）、甲苯、苯、汽油、離心管（瓶）不能與硫酸（50％、75％）、苯、汽油、煤油、等接觸使用。
5、冷凍離心機離心完畢后要擦干離心腔內水分，每星期對電機主軸的錐面上涂少許中性潤滑油脂保護，防止轉軸銹蝕。較長時間不用冷凍離心機應將轉子取出，擦干凈放置在干燥的地方，防止銹蝕。
6、為保證冷凍效果，當環境溫度高于30℃時，應對轉子和離心腔預冷，轉子還應降低轉速15％運轉。
7、離心管應定期更新，嚴禁使用瀕臨破裂的離心管。
8、每次使用前應注意檢查轉子有無腐蝕點和細微裂紋，禁止使用已腐蝕或有裂紋的轉子，使用超過保質期的轉子，以保障人身安全。
9、冷凍離心機轉子使用時一定要確認設置的轉子號正確無誤。若轉子號設置錯誤。會造成轉子超速使用或達不到所需的離心效果。特別是超速使用可能發生轉子炸裂的惡性事故，萬萬不可疏忽大意。
